
BOOKS - Application of Omic Techniques to Identify New Biomarkers and Drug Targets fo...

Application of Omic Techniques to Identify New Biomarkers and Drug Targets for COVID-19
Author: Paul C. Guest
Year: 2023
Format: PDF
File size: PDF 23 MB
Language: English

Year: 2023
Format: PDF
File size: PDF 23 MB
Language: English

Book Application of Omic Techniques to Identify New Biomarkers and Drug Targets for COVID-19 Introduction: The COVID-19 pandemic, caused by the SARS-CoV-2 virus, has affected nearly every country and territory in the world, with disparities in distribution leading to multiple waves of outbreaks and the emergence of variants of concern, some of which have enhanced infectivity and ability to evade existing vaccines. As such, there is an increasing interest in understanding the evolution of viruses like SARS-CoV-2, as well as improving our capacity to effectively current and manage future pandemics. This new volume reviews the most effective omic techniques for increasing our understanding of COVID-19, including genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics, to improve diagnostics, prognostics, and genomic surveillance, and to facilitate development of effective treatments and vaccines. Chapter 1: Genomics and COVID-19 In this chapter, we explore the use of genomics techniques to understand the evolution of SARS-CoV-2 and its interaction with the human host. The chapter begins with an overview of the current state of genomics research on COVID-19, including the development of next-generation sequencing technologies and the use of machine learning algorithms to analyze large datasets. We then delve into the specific applications of genomics in identifying new biomarkers and drug targets, including the use of whole-genome sequencing, RNA sequencing, and single-nucleotide polymorphism (SNP) analysis.
Book Application of Omic Techniques to Identify New Biomarkers and Drug Targets for COVID-19 Introduction: Пандемия COVID-19, вызванная вирусом SARS-CoV-2, затронула почти все страны и территории мира, при этом различия в распределении привели к множественным волнам вспышек и появлению вызывающих озабоченность вариантов, некоторые из которых повысили инфекционность и способность уклоняться от существующих вакцин. Таким образом, растет интерес к пониманию эволюции вирусов, таких как SARS-CoV-2, а также к улучшению нашей способности эффективно управлять текущими пандемиями и управлять ими в будущем. В этом новом томе рассматриваются наиболее эффективные омические методы для улучшения нашего понимания COVID-19, включая геномику, транскриптомику, протеомику и метаболомику, для улучшения диагностики, прогностики и геномного надзора, а также для облегчения разработки эффективных методов лечения и вакцин. Глава 1: Геномика и COVID-19 В этой главе мы исследуем использование методов геномики, чтобы понять эволюцию SARS-CoV-2 и его взаимодействие с человеком-хозяином. Глава начинается с обзора текущего состояния исследований геномики COVID-19, включая разработку технологий секвенирования следующего поколения и использование алгоритмов машинного обучения для анализа больших наборов данных. Затем мы углубляемся в конкретные применения геномики для выявления новых биомаркеров и мишеней для лекарств, включая использование секвенирования всего генома, секвенирования РНК и анализа однонуклеотидного полиморфизма (SNP).
Book Application of Omic Techniques to Identify New Biomarkers and Drug Targets for COVID-19 Introduction : La pandémie de COVID-19 causée par le virus SARS-CoV-2 a touché presque tous les pays et territoires du monde, avec des différences dans la distribution les vagues d'épidémies et l'émergence d'options préoccupantes, dont certaines ont accru l'infectiosité et la capacité d'échapper aux vaccins existants. Ainsi, on s'intéresse de plus en plus à la compréhension de l'évolution de virus comme le SARS-CoV-2 et à l'amélioration de notre capacité à gérer et à gérer efficacement les pandémies actuelles à l'avenir. Ce nouveau volume examine les méthodes ohmiques les plus efficaces pour améliorer notre compréhension de la COVID-19, y compris la génomique, la transcriptomique, la protéomique et la métabolomique, pour améliorer le diagnostic, la prédiction et la surveillance génomique, et pour faciliter le développement de traitements et de vaccins efficaces. Chapitre 1 : Génomique et COVID-19 Dans ce chapitre, nous étudions l'utilisation des techniques génomiques pour comprendre l'évolution du SRAS-CoV-2 et ses interactions avec l'homme hôte. chapitre commence par un examen de l'état actuel de la recherche sur la génomique de COVID-19, y compris le développement de technologies de séquençage de prochaine génération et l'utilisation d'algorithmes d'apprentissage automatique pour analyser de grands ensembles de données. Nous approfondirons ensuite les applications spécifiques de la génomique pour identifier de nouveaux biomarqueurs et cibles pour les médicaments, y compris l'utilisation du séquençage du génome entier, le séquençage de l'ARN et l'analyse du polymorphisme mononucléotide (SNP).
Aplicación del libro de Técnicas Omicas para Identificar Nuevos Biomarkers y Drug Targets para COVID-19 Introducción: Pandemia de COVID-19 causada por el virus SARS-CoV-2, ha afectado a casi todos los países y territorios del mundo, y las diferencias en la distribución han dado lugar a múltiples oleadas de brotes y a opciones preocupantes, algunas de las cuales han aumentado la infectividad y la capacidad de evadir las vacunas existentes. Así, cada vez hay más interés en entender la evolución de virus como el SARS-CoV-2, así como en mejorar nuestra capacidad para gestionar y gestionar de forma eficaz las pandemias actuales en el futuro. Este nuevo volumen aborda las técnicas omicas más eficaces para mejorar nuestra comprensión del COVID-19, incluyendo genómica, transcriptomía, proteómica y metabolómica, para mejorar el diagnóstico, pronóstico y supervisión genómica, y para facilitar el desarrollo de tratamientos y vacunas eficaces. Capítulo 1: Genómica y COVID-19 En este capítulo investigamos el uso de técnicas genómicas para entender la evolución del SARS-CoV-2 y su interacción con el huésped humano. capítulo comienza con una revisión del estado actual de los estudios de genómica COVID-19, incluyendo el desarrollo de tecnologías de secuenciación de próxima generación y el uso de algoritmos de aprendizaje automático para analizar grandes conjuntos de datos. A continuación, profundizamos en las aplicaciones específicas de la genómica para identificar nuevos biomarcadores y dianas para medicamentos, incluyendo el uso de secuenciación de todo el genoma, secuenciación de ARN y análisis de polimorfismo uninucleótido (SNP).
Book Aplicação de Tecnologia Omic to Identidade New Biomarkers and Drug Targets for COVID-19 Introdução: A pandemia COVID-19 causada pelo vírus SARS-CoV-2 afetou quase todos os países e territórios do mundo, e as diferenças de distribuição resultaram em múltiplas pandemias ondas de surtos e variantes preocupantes, algumas das quais aumentaram a infecciosidade e a capacidade de se esquivar das vacinas existentes. Assim, há um crescente interesse em compreender a evolução dos vírus, como a SARS-CoV-2, e melhorar a nossa capacidade de gerenciar e gerenciar as pandemias atuais no futuro. Este novo volume aborda as técnicas homológicas mais eficazes para melhorar a nossa compreensão do COVID-19, incluindo genômicos, transcrópicos, proteômicos e metabolômicos, para melhorar o diagnóstico, o prognóstico e a supervisão genômica, e facilitar o desenvolvimento de tratamentos eficazes e vacinas. Capítulo 1: Genômica e COVID-19 Neste capítulo, investigamos o uso de técnicas de genômica para compreender a evolução da SARS-CoV-2 e sua interação com o homem-mestre. O capítulo começa com uma revisão do estado atual da pesquisa de genômica COVID-19, incluindo o desenvolvimento de tecnologias de sequenciamento de próxima geração e o uso de algoritmos de aprendizado de máquina para analisar grandes conjuntos de dados. Em seguida, nos aprofundamos em aplicações específicas da genômica para identificar novos biomarcadores e alvos para medicamentos, incluindo o sequenciamento de todo o genoma, o sequenciamento de RNA e a análise do polimorfismo uninucleotídico (SNP).
Book Application of Omic Technics to Identity New Biomarkers and Drug Targets for COVID-19 Introduction: La pandemia COVID-19 causata dal virus del SARS-CoV-2 ha colpito quasi tutti i paesi e i territori del mondo, con differenze di distribuzione che hanno portato a una pandemia multipla le ondate di focolai e la comparsa di opzioni preoccupanti, alcune delle quali hanno aumentato l'infettività e la capacità di sfuggire ai vaccini esistenti. In questo modo, c'è sempre più interesse a comprendere l'evoluzione dei virus, come il virus, e a migliorare la nostra capacità di gestire e gestire efficacemente le pandemie in corso. Questo nuovo volume affronta i metodi omici più efficaci per migliorare la nostra comprensione di COVID-19, inclusa la genomica, la trascrittomatica, la proteomica e la metabolica, per migliorare la diagnosi, la prognosi e la supervisione genomica e per facilitare lo sviluppo di terapie efficaci e vaccini. Capitolo 1: Genomica e COVID-19 In questo capitolo stiamo esaminando l'uso di tecniche di genomica per comprendere l'evoluzione del SARS-CoV-2 e la sua interazione con l'uomo ospite. Il capitolo inizia con una panoramica sullo stato attuale degli studi di genomica di COVID-19, tra cui lo sviluppo di tecnologie di sequenziamento di nuova generazione e l'utilizzo di algoritmi di apprendimento automatico per l'analisi di grandi set di dati. Poi stiamo approfondendo le specifiche applicazioni della genomica per individuare nuovi biomarcatori e bersagli per i farmaci, tra cui l'uso del sequenziamento dell'intero genoma, il sequenziamento dell'RNA e l'analisi del polimorfismo uninominale (SNP).
Book Application of Omic Techniques to Identify New Biomarkers and Drug Targets for COVID-19 Einleitung: Die COVID-19-Pandemie, die durch das SARS-CoV-2-Virus verursacht wurde, betraf fast alle Länder und Gebiete der Welt, wobei Unterschiede in der Verteilung zu mehreren Ausbruchswellen und dem Auftreten von besorgniserregende Varianten, von denen einige die Infektiosität und die Fähigkeit, bestehende Impfstoffe zu umgehen, erhöht haben. Daher besteht ein wachsendes Interesse daran, die Evolution von Viren wie SARS-CoV-2 zu verstehen und unsere Fähigkeit zu verbessern, aktuelle Pandemien in Zukunft effektiv zu bewältigen und zu bewältigen. Dieser neue Band untersucht die effektivsten ohmschen Techniken, um unser Verständnis von COVID-19 zu verbessern, einschließlich Genomik, Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik, um die Diagnose, Prognose und genomische Überwachung zu verbessern und die Entwicklung wirksamer Therapien und Impfstoffe zu erleichtern. Kapitel 1: Genomik und COVID-19 In diesem Kapitel untersuchen wir den Einsatz genomischer Methoden, um die Evolution von SARS-CoV-2 und seine Interaktion mit dem menschlichen Wirt zu verstehen. Das Kapitel beginnt mit einem Überblick über den aktuellen Stand der COVID-19-Genomik-Forschung, einschließlich der Entwicklung von Sequenzierungstechnologien der nächsten Generation und des Einsatzes von maschinellen rnalgorithmen zur Analyse großer Datensätze. Dann tauchen wir in spezifische Anwendungen der Genomik ein, um neue Biomarker und Ziele für Medikamente zu identifizieren, einschließlich der Verwendung von genomweiten Sequenzierung, RNA-Sequenzierung und ngle Nucleotide Polymorphism (SNP) -Analyse.
Książka Zastosowanie Omic technik do identyfikacji nowych biomarkerów i narkotyków Cele dla COVID-19 Wprowadzenie: Pandemia COVID-19 spowodowana wirusem SARS-CoV-2 dotknęła niemal wszystkie kraje i terytoria świata, a różnice w rozmieszczeniu powodują wiele fal ognisk i pojawiają się opcje obaw, z których niektóre zwiększyły zakaźność i zdolność do unikania istniejących szczepionek. W ten sposób wzrasta zainteresowanie zrozumieniem ewolucji wirusów, takich jak SARS-CoV-2, a także poprawą naszej zdolności do skutecznego zarządzania i zarządzania obecną pandemią w przyszłości. Ten nowy tom bada najskuteczniejsze metody pomiarowe, aby poprawić nasze zrozumienie COVID-19, w tym genomikę, transkryptomikę, proteomikę i metabolomikę, poprawić diagnostykę, prognostykę i nadzór genomiczny, a także ułatwić rozwój skutecznych metod leczenia i szczepionek. Rozdział 1: Genomika i COVID-19 W tym rozdziale badamy wykorzystanie technik genomiki do zrozumienia ewolucji SARS-CoV-2 i jej interakcji z żywicielem człowieka. Rozdział rozpoczyna się od przeglądu aktualnego stanu badań genomiki COVID-19, w tym rozwoju technologii sekwencjonowania nowej generacji i wykorzystania algorytmów uczenia maszynowego do analizy dużych zbiorów danych. Następnie zagłębiamy się w konkretne zastosowania genomiki, aby zidentyfikować nowe biomarkery i cele narkotykowe, w tym wykorzystanie sekwencjonowania całego genomu, sekwencjonowania RNA i analizy pojedynczego polimorfizmu nukleotydowego (SNP).
יישום ספר של טכניקות אומיות לזיהוי ביו-מרקרים חדשים ומטרות סמים למבוא COVID-19: מגיפת COVID-19 שנגרמה על ידי נגיף SARS-CoV-2 השפיעה על כמעט כל המדינות והטריטוריות של העולם, עם הבדלי תפוצה שנגרמו כתוצאה מגלים מרובים של התפרצויות והתהוות של אפשרויות דאגה, שחלקן הגבירו את האינפקטיביות ואת היכולת לחמוק מחיסונים קיימים. כך, יש עניין הולך וגדל בהבנת האבולוציה של וירוסים כמו סארס-CoV-2, כמו גם בשיפור היכולת שלנו לנהל ולנהל בצורה יעילה מגפות עכשוויות בעתיד. נפח חדש זה בוחן את השיטות היעילות ביותר לשיפור ההבנה שלנו של COVID-19, כולל גנומיקה, טרנסקריפטומיקה, פרוטאומיקה ומטבולומיקה, כדי לשפר את האבחנה, פרוגנוסטיקה ומעקב גנומי, וכדי להקל על פיתוח טיפולים וחיסונים יעילים. פרק 1: גנומיקה ו COVID-19 בפרק זה, אנו חוקרים את השימוש בטכניקות גנומיקה כדי להבין את האבולוציה של סארס-CoV-2 ואת האינטראקציה שלה עם המארח האנושי. הפרק מתחיל עם סקירה של המצב הנוכחי של מחקר גנומיקה COVID-19, כולל פיתוח טכנולוגיות ריצוף מהדור הבא ושימוש באלגוריתמים ללימוד מכונה לניתוח נתונים גדולים. לאחר מכן אנו מתעמקים ביישומים ספציפיים של גנומיקה כדי לזהות ביומרקרים חדשים ומטרות סמים, כולל שימוש בריצוף גנום שלם, ריצוף RNA, ופולימורפיזם נוקלאוטידי יחיד (SNP).''
COVID-19 için Yeni Biyobelirteçleri ve İlaç Hedeflerini Tanımlamak için Omik Tekniklerin Kitap Uygulaması Giriş: SARS-CoV-2 virüsünün neden olduğu COVID-19 pandemisi, dünyanın hemen hemen tüm ülkelerini ve bölgelerini etkilemiş, dağıtım farklılıkları çok sayıda salgın dalgasına ve endişe seçeneklerinin ortaya çıkmasına neden olmuştur, bunlardan bazıları bulaşıcılığı ve mevcut aşılardan kaçma yeteneğini arttırmıştır. Bu nedenle, SARS-CoV-2 gibi virüslerin evrimini anlama ve gelecekte mevcut salgınları etkin bir şekilde yönetme ve yönetme yeteneğimizi geliştirme konusunda artan bir ilgi var. Bu yeni cilt, genomik, transkriptomik, proteomik ve metabolomik dahil olmak üzere COVID-19 hakkındaki anlayışımızı geliştirmek, tanı, prognostik ve genomik sürveyansı iyileştirmek ve etkili tedavilerin ve aşıların geliştirilmesini kolaylaştırmak için en etkili omik yöntemleri incelemektedir. Bölüm 1: Genomik ve COVID-19 Bu bölümde, SARS-CoV-2'nin evrimini ve insan konakçısı ile etkileşimini anlamak için genomik tekniklerin kullanımını araştırıyoruz. Bölüm, yeni nesil sıralama teknolojilerinin geliştirilmesi ve büyük veri kümelerini analiz etmek için makine öğrenme algoritmalarının kullanılması da dahil olmak üzere COVID-19 genomik araştırmalarının mevcut durumuna genel bir bakış ile başlar. Daha sonra, tüm genom dizilemesi, RNA dizilemesi ve tek nükleotid polimorfizmi (SNP) analizinin kullanımı da dahil olmak üzere yeni biyobelirteçleri ve ilaç hedeflerini tanımlamak için genomiklerin spesifik uygulamalarını inceliyoruz.
كتاب تطبيق تقنيات Omic لتحديد المؤشرات الحيوية الجديدة والأهداف الدوائية لـ COVID-19 مقدمة: أثرت جائحة كوفيد-19 الناجمة عن فيروس سارس-كو-2 على جميع بلدان وأقاليم العالم تقريبًا، حيث أدت اختلافات التوزيع إلى موجات متعددة من الفاشيات وظهور خيارات مثيرة للقلق، أدى بعضها إلى زيادة العدوى والقدرة على التهرب من اللقاحات الموجودة. وبالتالي، هناك اهتمام متزايد بفهم تطور الفيروسات مثل SARS-CoV-2، بالإضافة إلى تحسين قدرتنا على إدارة وإدارة الأوبئة الحالية بشكل فعال في المستقبل. يفحص هذا المجلد الجديد أكثر طرق omics فعالية لتحسين فهمنا لـ COVID-19، بما في ذلك علم الجينوم وعلم النسخ وعلم البروتيوميات وعلم الأيض، لتحسين التشخيص والتشخيص والمراقبة الجينية، ولتيسير تطوير العلاجات واللقاحات الفعالة. الفصل 1: علم الجينوم و COVID-19 في هذا الفصل، نستكشف استخدام تقنيات الجينوم لفهم تطور SARS-CoV-2 وتفاعله مع المضيف البشري. يبدأ الفصل بلمحة عامة عن الحالة الحالية لأبحاث الجينوم COVID-19، بما في ذلك تطوير تقنيات تسلسل الجيل التالي واستخدام خوارزميات التعلم الآلي لتحليل مجموعات البيانات الكبيرة. ثم نتعمق في تطبيقات محددة لعلم الجينوم لتحديد المؤشرات الحيوية الجديدة والأهداف الدوائية، بما في ذلك استخدام تسلسل الجينوم الكامل، وتسلسل الحمض النووي الريبي، وتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية (SNP).
COVID-19 소개를위한 새로운 바이오 마커 및 약물 대상을 식별하기위한 Omic 기술의 예약 적용: SARS-CoV-2 바이러스로 인한 COVID-19 전염병은 전 세계 거의 모든 국가와 지역에 영향을 미쳤으며, 분포 차이로 인해 여러 번의 발생과 우려 옵션의 출현이 발생했습니다. 기존 백신을 피하는 능력. 따라서 SARS-CoV-2와 같은 바이러스의 진화를 이해하고 향후 현재 전염병을 효과적으로 관리하고 관리하는 능력을 향상시키는 데 관심이 커지고 있습니다. 이 새로운 책은 유전체학, 전 사체, 단백질 학 및 대사 체학을 포함한 COVID-19에 대한 이해를 향상시키고 진단, 예후 및 게놈 감시를 개선하고 효과적인 치료 및 백신의 개발을 촉진하는 가장 효과적인 오믹스 방법을 검사합니다. 1 장: 유전체학 및 COVID-19 이 장에서 우리는 SARS-CoV-2의 진화와 인간 숙주와의 상호 작용을 이해하기 위해 유전체학 기술의 사용을 탐구합니다. 이 장은 차세대 시퀀싱 기술의 개발과 대규모 데이터 세트를 분석하기위한 기계 학습 알고리즘의 사용을 포함하여 현재 COVID-19 유전체학 연구 상태에 대한 개요로 시작합니다. 그런 다음 전체 게놈 시퀀싱, RNA 시퀀싱 및 단일 뉴클레오티드 다형성 (SNP) 분석의 사용을 포함하여 새로운 바이오 마커 및 약물 표적을 식별하기 위해 유전체학의 특정 응용을 조사합니다.
COVID-19導入のための新しいバイオマーカーと薬物ターゲットを識別するためのオミック技術のブックアプリケーション: SARS-CoV-2ウイルスによって引き起こされたCOVID-19のパンデミックは、世界のほぼすべての国と地域に影響を与えており、分布の違いにより、複数の発生の波が発生し、懸念の選択肢が出現した。したがって、SARS-CoV-2のようなウイルスの進化を理解し、将来の現在のパンデミックを効果的に管理および管理する能力を向上させることへの関心が高まっています。この新しいボリュームでは、ゲノミクス、トランスクリプトミクス、プロテオミクス、メタボロミクスなどのCOVID-19の理解を向上させ、診断、予後、ゲノム監視を改善し、効果的な治療とワクチンの開発を促進するための最も効果的なオミクス法を検討します。Chapter 1: Genomics and COVID-19この章では、SARS-CoV-2の進化とヒト宿主との相互作用を理解するためのゲノミクス技術の使用を検討します。本章では、COVID-19ゲノミクス研究の現状を概観し、次世代シーケンシング技術の開発や大型データセットの解析における機械学習アルゴリズムの活用などを紹介します。次に、ゲノムシーケンシング、RNAシーケンシング、単一ヌクレオチド多型(SNP)解析など、新たなバイオマーカーや薬物ターゲットを特定するためのゲノミクスの具体的な応用を検討します。
關於COVID-19簡介:SARS-CoV-2病毒引起的COVID-19大流行影響世界幾乎所有國家和地區的識別新生物制藥商和毒品目標的書籍申請這種分布差異導致了多波爆發和令人擔憂的變種,其中一些變種提高了傳染性和逃避現有疫苗的能力。因此,人們越來越有興趣了解SARS-CoV-2等病毒的進化,並提高我們有效管理和管理當前流行病的能力。本新書探討了改善我們對COVID-19理解的最有效的歐姆技術,包括基因組學、轉錄組學、蛋白質組學和代謝組學,以改善診斷、預測和基因組監測,並促進有效治療和疫苗的發展。第一章:基因組學和COVID-19在本章中,我們研究使用基因組學技術了解SARS-CoV-2的進化及其與宿主人類的相互作用。本章首先回顧了COVID-19基因組學研究的現狀,包括開發下一代測序技術,以及使用機器學習算法分析大型數據集。然後,我們將深入研究基因組學的具體應用,以識別藥物的新生物標誌物和靶標,包括使用全基因組測序,RNA測序和單核苷酸多態性(SNP)分析。
